Marin et Corail vivent dans les eaux tropicales de la Grande Barrière de corail, c’est ici qu’ils souhaitent donner naissance à leurs petits. Mais à la suite d’une attaque d’un barracuda, Marin perdit sa compagne et n’eut pour seul rescapé qu’un seul œuf abîmé, mais encore en vie. Désormais tout tourne autour de la vie de son fils, Nemo, qui avait une nageoire atrophié à la suite de l’attaque. Marin traumatisé par ce jour, vis dans la peur de perdre son fils à jamais. Et ce jour arriva, Nemo fut capturé par des humains et Marin se lancera à sa recherche en compagnie de Doris. Une incroyable aventure commence alors pour le père.